У грызунов в желудочно-кишечном тракте паразитируют следующие виды нематод:
у кроликов и шиншилл :
- Passalurus ambiguus и Graphidium strigosum, Trichostrongilus columbiformes, Ascaris columnaris,
Osterguria spp
- у мышей:
- Syphacia obvelata и Aspiculurus tetraptera, -Heterakis spumosa
- у крыс - Heterakis spumosa
- у морских свинок - Paraspidodera uncunata,
- у ондатры - Ascaris lumbicoides, Trichurus opaca, Sinhimantus longigutxtruatus
у нутрий -- Heligmosomum sprehni, Strongiloides myopotami, Ransomus rodentonum
У многих видов грызунов паразитируют виды Nematodirus spp., Dermatoxis veligera, Passalurus nonanulatus, Micipsella brevicauda.
У бобров, хомяков и леммингов регистрируется Trichinella spiralis. Заболевание у этих животных протекает бессимптомно.
У экзотических крыс из тропического пояса Австралии, юго-восточной Азии и островов Тихого океана обнаруживают легочных гельминтов Angiostrongylus cantonensis.
Цестоды мышей, крыс, хомяков и кроликов (Hyminolepis nana, Hyminolepis diminuta) могут развиваться как геогельминты или с участием промежуточных хозяев - мух и жуков.
К гименолипедозу восприимчив человек.
Цестод Paranoplocephala variabilis, Paranoplocephala infequens обнаруживали у сусликов, Raillietina retractilis -у белок , Taenia multiceps - у зайцев и кроликов, Taenia mustalae - у леммингов.
Coenurus serialis паразитирует в подкожной клетчатке многих видов грызунов.
У грызунов часто обнаруживают трематод: Hasstilesia tricolor, Strichorchis subtriquetrus, Quinqueserialis quinqueserialis, Nudacotylus novicia, Schistosomatium douthitti, Notocotilus urbanensis, Metorchis conjunnctus, Wardius zibethicus, Echinostomum revolutum, Nudacotyle novica, Catatropis fimbriata, Ribeiroia odatrae.
У нутрий регистрировали фасциолез (Fasciola hepatica - в печени).
Акантоцефалезы у грызунов вызывают Macrocanthorhynchus hirudinaceus, Moniliformis clarki, Pneumocoptes banksi.
Из протозоозов у грызунов особое значение имеют кокцидиозы, возбудителями которых являются Eimeria maxima E.media, E.perfomans, E.irresidua, E. stiadae, E. caviae, Eimeria dorneyi, E.parasciurorum.
У многих экзотических грызунов паразитирует тканевая форма кошачьей токсоплазмы.
У кроликов, мышей и шиншил отмечают гиардиоз (Giardia spp.), а у белок, и некоторых видов мышей - бабезиоз (Babesia microti, B.graingeri)